Քանի որ լոլիկի շագանակագույն ռուգոզե մրգային վիրուսը վարակում է լոլիկի և պղպեղի բույսերն ամբողջ աշխարհում, սերմացու արտադրող ընկերությունները աշխատում են դիմացկուն լոլիկի բուծման վրա:
Հարուստ գենետիկական և գենոմային ռեսուրսները հասանելի էին լոլիկի բուծողների համար նույնիսկ մինչև լոլիկի գենոմային հաջորդականության նախագծերի սկիզբը: Մի քանի վայրերում վաղուց ստեղծվել են լոլիկի մանրէաբանական մեծ հավաքածուներ: Ավելի քան 75,000 լոլիկի միացումներ պահպանվում են ամբողջ աշխարհի գենբանկերում: Ամենամեծերից մեկը ԱՄՆ դոլարի գենբանկն է Ժնևում, Նյու Յորք:
Լոլիկի գենոմի հաջորդականությունը սկսվել է 2005 թվականին որպես բազմազգ ջանքեր 14 երկրների միջև և ավարտվել 2012 թվականին: Այս ջանքերը մեծապես արագացել են արհեստական ինտելեկտի, մեքենայական ուսուցման և առաջադեմ ալգորիթմների կիրառմամբ՝ մեծ քանակությամբ գենետիկ և ֆենոտիպային տվյալների վերլուծության համար:
Լոլիկի համագենոմ
Բոյս Թոմփսոնի ինստիտուտի հետազոտողները 2020 թվականին ստեղծել են վայրի լոլիկի բարձրորակ տեղեկատու գենոմ՝ ավելի ամբողջական և օգտակար լոլիկի համագենոմ ստանալու համար: Նրանք հայտնաբերել են գենոմի հատվածներ, որոնք ընկած են մրգի համի, չափի և հասունացման, սթրեսի նկատմամբ հանդուրժողականության և հիվանդությունների դիմադրության հիմքում: Մասամբ շնորհիվ առաջադեմ հաջորդականության տեխնոլոգիաների, որոնք կարող են կարդալ ԴՆԹ-ի շատ երկար կտորներ, հղման գենոմն ավելի ամբողջական և ճշգրիտ է, քան առկա տվյալների բազան:
Հերթական հաջորդականության տեխնոլոգիաները, որոնք կարդում են ԴՆԹ-ի ավելի կարճ հատվածները, նույնականացնում են մուտացիաները մեկ բազայի մակարդակում: Այնուամենայնիվ, նրանք լավ չեն գտնում կառուցվածքային տարբերակներ, ինչպիսիք են ԴՆԹ-ի մեծ կտորների ներդիրները, ջնջումները, շրջումները կամ կրկնօրինակումները:
2019 թվականին հետազոտողների միջազգային խումբը կառուցեց լոլիկի համագենոմը՝ օգտագործելով 725 ֆիլոգենետիկորեն և աշխարհագրորեն ներկայացուցչական սորտերի գենոմի հաջորդականությունը: Այս տվյալների բազան ներառում է 4,873 գեն, որոնք չեն գտնվել սկզբնական տեղեկատու գենոմում: Ներկա/բացակա տատանումների վերլուծությունները բացահայտեցին գեների զգալի կորուստ և գեների և խթանիչների ինտենսիվ բացասական ընտրություն լոլիկի ընտելացման և բարելավման ժամանակ:
Ամբողջական հոդվածը կարդացեք www.seedworld.com կայքում: